Base azotée
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| Base azotée | Nucléoside |
|---|---|
 Adénine |
 Adénosine A |
 Guanine |
 Guanosine G |
 Thymine |
 Thymidine T |
 Uracile |
 Uridine U |
 Cytosine |
 Cytidine C |
Les bases azotées (aussi appelées bases nucléiques ou nucléobases) sont des molécules qui font partie des nucléotides, qui sont eux-mêmes des éléments de l'ARN et de l'ADN.
C'est par les liens hydrogène entre paire de bases azotées que sont liés deux brins de l'hélice d'ADN ou d'ARN.
Il existe cinq bases azotées : adénine, cytosine, guanine, thymine et uracile. L'adénine, la thymine, la cytosine et la guanine sont présentes sur les nucléotides de l'ADN, l'uracile remplace la thymine sur les nucléotides de l'ARN. Leurs abréviations respectives sont A, C, G, T et U. Généralement on identifie le nom de la nucléobase au nom du nucléotide correspondant.
La séquence de base d'un acide nucléique permet de déterminer dans le cas d'un gène la séquence d'acides aminés du polypeptide concerné. On peut trouver néanmoins d'autres bases comme la dihydrouridine (DHU), l'inosine ou encore la xanthine ou la pseudo-uracile qui découlent de modifications effectuées sur les bases présentées précédemment.
On distingue les bases puriques et les bases pyrimidiques.
[modifier] Les bases puriques
Ces bases contiennent deux cycles: un cycle purique et un cycle pyrimidique. Les atomes composant ces bases sont numérotés de la façon suivante: le cycle purique dans le sens horaire et le cycle pyrimidique dans le sens anti-horaire.
[modifier] Les bases pyrimidiques
- La cytosine : 4-amino-2-oxopyrimidine
- La thymine : 5-méthyl-2,4-dioxopyrimidine
- L'uracile : 2,4-dioxopyrimidine
Ces bases contiennent un seul cycle et sont numérotées dans le sens horaire.
[modifier] Le code à une Lettre
Les séquences nucléotidiques sont représentées comme une succession de bases azotées, symbolisées par une lettre, de 5' vers 3'. Exemple: atgc signifie que nous avons à partir de l'extrémité 5' , des nucléotides, portant successivement une adénine, une thymine, une guanine et une cytidine.
| Base ou type de bases | code à une lettre |
|---|---|
| Adenine | a |
| Thymine | t |
| Guanine | g |
| Cytosine | c |
| Inosine | i |
| Uracile | u |
| Purine : Adenine or Guanine | r |
| Weak Hydrogen bonds : Adenine or Thymine | w |
| Keto in major groove: Thymine or Guanine | k |
| Not Adenine | b |
| Not Thymine | v |
| Pyrimidine: Thymine or Cytosine | y |
| Strong hydrogen bonds: Cytosine or Guanine | s |
| Amino in major groove: Adenine or Cytosine | m |
| Not Cytosine | d |
| Not Guanine | h |
| Any | n |
| Acides nucléiques éditer le modèle |
|---|
|
Nucléobases (bases azotées) Adénosine - Ribothymidine (rare) - Uridine Désoxyadénosine - Désoxythymidine - Désoxyuridine AMP - TMP - UMP - GMP - CMP dAMP - dTMP - dUMP - dGMP - dCMP |
